El Consejo para la Educación Superior de Fasta (CONEDUSUP) tiene la misión de establecer políticas para las distintas obras educativas de nivel superior vinculadas a la Ciudad Miliciana. Su trabajo se organiza a través de subcomisiones que atienden los distintos espacios educativos.
Con la finalidad de optimizar la coordinación y la gestión estratégica de los Centros de Educación Superior (CES), la subcomisión encargada de estos resolvió constituir un órgano de coordinación general denominado Consejo Superior; y la creación de un órgano de conducción para cada centro que fue denominado Consejo Directivo.
Los Centros de Educación Superior integran a los Institutos Superiores, las Unidades de Apoyo Académico, el Centro de Capacitación de la Universidad Fasta (CECAUF) y los Centros de Capacitación y Transferencia (CCyT).